珍珠是由珍珠贝外套膜的一部分细胞，在结缔组织内形成珍珠襄分泌珍珠质而产生的。在自然条件下砂粒和寄生虫等外来物质的偶然侵入，就给珍珠质分泌组织（外套膜外侧上皮细胞）以有效的刺激，引起该组织的畸形增殖，并在结缔组织内形成包围外来物质的珍珠襄，分泌珍珠质沉积在砂粒等外来物质上形成天然珍珠。天然珍珠的核是极小的石英砂粒，细菌、小虫等，质度细腻、硬度均匀、光泽柔和，珍珠层厚且呈半透明状，因核内异物不同，故外形圆度稍差。天然黑色优质珍珠较少，主要产于太平洋中南部，占总数99%。